Šiuo metu Lietuvoje ekologinės gamybos sertifikavimo paslaugas gali atlikti tik viena kontrolės institucija - VšĮ „Ekoagros“.Atkreipiame dėmesį, jog pasirinkus įmonę, kuri neturi tokiai veiklai reikalingo leidimo, tokios įmonės išrašyti patvirtinamieji dokumentai nebūtų pripažinti tinkamais, o juose nurodyta produkcija negalėtų būti laikoma ekologiška. Rinkai pateikta tokios įmonės sertifikuota produkcija turėtų būti išimta iš jos arba iš naujo ženklinta kaip įprastinė, rašoma ministerijos pranešime.Svarbu ir tai, kad tik VŠĮ „Ekoagros“ išduoti sertifikatai leidžia gauti kompensacines išmokas pagal Lietuvos kaimo plėtros 2014-2020 m. programos priemonę „Ekologinis ūkininkavimas“.